Bueno, a ver si te he entendido:Tienes una red y uno de los equipos de la red está ejecutando Linux con una partición FAT32 que es donde se encuentra la base de datos de Access.
Y quieres que otro equipo que está ejecutado Windows pueda acceder a la base de datos Access del Linux.
Si es así, tendrás que ejecutar el servidor Samba en Linux para compartir tus unidades de red. Y luego, en el BDE configuras donde está la base de datos.