Mucho me temo que vas a tener que reinstalar el sistema completo.
De todos modos, desinstala el Builder, usa el RegClean, y vuelve a instalar... pero tiene mala pinta.Debes acostumbrarte a tener siempre a mano una imagen del disco que funcione perfectamente, con programas como Norton Ghost o Image Drive. Así te evitaras disgustos como el de hoy.
Con Windows, todas las precauciones son pocas.